Az Információs Hivatal önálló gazdálkodást folytató költségvetési szerv. A Hivatal költségvetési gazdálkodásáért, a könyvvezetési és beszámolási kötelezettség
teljesítéséért a főigazgató felelős.
A Hivatal költségvetésére az irányító miniszter tesz javaslatot. Gyakorolja, illetve teljesíti a fejezetért felelős szerv vezetőjének, valamint a felügyeletért
felelős szerv vezetőjének tervezési, előirányzat-módosítási, beszámolási, információszolgáltatási, pénzügyi jogait és kötelezettségeit. A miniszter ellenőrzi - célszerűségi
és eredményességi szempontból - a gazdálkodást.
A Hivatal részletes költségvetését a benne szereplő minősített adatok miatt csak az Országgyűlés Nemzetbiztonsági Bizottsága, a Nemzetgazdasági Minisztérium illetékes
részlege, valamint - ellenőrzési tevékenysége során - az Állami Számvevőszék és a Kormányzati Ellenőrzési Hivatal ismerheti meg.
Az Információs Hivatal titkosszolgálati tevékenységéhez, a titkos információgyűjtés eszközeinek és módszereinek
alkalmazásához közvetlenül kötődő személyi és tárgyi vonatkozású kiadások fedezésére elkülönített előirányzatot szerepeltet. A "Dologi kiadások" kiemelt előirányzata
az általános számviteli szabályoktól eltérően - a kiadások jellegétől függetlenül - egy összegben tartalmazza ezeket a speciális működési kiadásokat. (Pl.
a külföldi ügynökkel lebonyolított találkozó költségét nem "reprezentációs", "étkeztetési" vagy "utazási" költségként kell elszámolni.)
A Hivatal a speciális működési kiadások előirányzatából teljesíti a kifizetéseket a vele titkosan együttműködő személyek
részére is. Ebből a Hivatal 20%-os forrásadót von le és fizet be az adóhatóságnak, a magánszemélynek ezt a jövedelmet nem kell az összevont adóalapjába beszámítania
és nem kell bevallania. A Hivatal az ilyen kifizetésekről nem köteles személyre szólóan adatot szolgáltatni és a magánszemélynek igazolást kiadni.
A speciális működési kiadások felhasználását külső szerv kizárólag törvényességi szempontból ellenőrizheti (célszerűségi és eredményességi szempontból nem), s nem
kerülhet birtokába a titkos információgyűjtés során keletkezett információra, forrásra, a titkos információgyűjtő módszer konkrét jellegére utaló adat.
Sajátos előírások vonatkoznak a Hivatal minősített adatot érintő, illetőleg nemzetbiztonsági érdekkel összefüggő közbeszerzéseire is: Az Országgyűlés
Nemzetbiztonsági Bizottsága e körben az általános szabályok - a közbeszerzési törvény - alkalmazását előzetesen kizárhatja.